460 articoli
Questo studio integra dati genomici e modelli di nicchia ecologica per dimostrare come i cicli climatici abbiano plasmato la storia demografica, la divergenza genomica e la separazione tra le popolazioni continentali e peninsulari del cuculo cactus (Campylorhynchus brunneicapillus) nei deserti nordamericani.
Questo studio analizza i proteomi dell'smalto dentale antico per comprendere come i processi di amelogenesi, in particolare la digestione enzimatica e la fosforilazione, influenzino la conservazione delle proteine e per sviluppare un nuovo marcatore basato sulla fosforilazione per la determinazione del sesso genetico.
Il metodo WINDEX migliora il rilevamento e la localizzazione delle mutazioni adattative integrando gerarchicamente statistiche basate su singoli siti e finestre genomiche, permettendo di stimare che tra il 9,7% e il 10,5% dei genomi umani sia soggetto a selezione positiva.
Questo studio utilizza un modello di coevoluzione annidata per dimostrare che le coinfezioni, attraverso un effetto di selezione cinetica, favoriscono una virulenza parassitaria inferiore e una resistenza dell'ospite maggiore rispetto alle superinfezioni, con l'entità di tale effetto che dipende dal grado di accoppiamento spaziale delle popolazioni.
Lo studio rivela che la vulnerabilità degli uccelli endemici delle isole tropicali ai cambiamenti climatici è determinata dalle loro caratteristiche biologiche e dalla storia demografica, evidenziando come le specie con diete specializzate e di grandi dimensioni abbiano subito un calo demografico durante l'ultimo periodo glaciale e necessitino di strategie di conservazione che integrino questi fattori storici.
Lo studio analizza il ruolo delle varianti strutturali genomiche nella speciazione dei cervi del genere *Odocoileus*, rivelando che le mutazioni specifiche di specie, spesso associate a geni legati alla riproduzione e all'adattamento sensoriale, potrebbero aver favorito l'isolamento riproduttivo e la divergenza evolutiva.
Uno studio di simulazione suggerisce che l'immunità adattativa nei vertebrati si sia evoluta non principalmente per difendersi dai parassiti, ma per gestire le complesse interazioni con i microrganismi benefici, permettendo allo stesso tempo di mitigare i rischi di infezioni parassitarie occasionali.
Questo studio dimostra come il "bias di Occam", derivante dalla mancata modellazione delle relazioni tra predittori nei modelli lineari filogenetici, distorca le inferenze ecologiche ed evolutive, proponendo l'adozione di strutture multi-risposta per correggere tale distorsione e rivedere le ipotesi esistenti.
Lo studio dimostra che i tratti correlati al sistema nervoso centrale, inclusi i disturbi psichiatrici, presentano architetture genetiche distinte caratterizzate da varianti ad alta frequenza e soggetti a forti vincoli selettivi, il che spiega la loro minore significatività statistica nelle associazioni genomiche rispetto ad altri tratti complessi.
Questo studio dimostra che l'architettura genotipo-fenotipo, attraverso la sua influenza sulla correlazione o modularità dei tratti, agisce come un filtro critico per la biodiversità, dove l'architettura correlata favorisce la coesistenza in paesaggi a bassa migrazione con forte selezione, mentre quella modulare supporta la diversità in contesti ad alta migrazione grazie alla sua flessibilità adattativa.
Questo studio caratterizza il repertorio dei geni TLR negli elasmobranchi, rivelando modelli di duplicazione e perdita specifici del lignaggio, una forte selezione purificante con siti selezionati positivamente e una co-localizzazione con regioni genomiche ricche di geni immunitari, inclusi i paraloghi MHC, che suggerisce un hotspot ancestrale per l'immunità dei vertebrati.
Questo studio integra fenotipizzazione basata sull'intelligenza artificiale e genomica comparativa per dimostrare che l'evoluzione convergente dei pattern alari nelle farfalle *Heliconius* avviene attraverso cambiamenti regolatori specifici di ciascuna linea evolutiva all'interno di architetture genetiche conservate.
Lo studio ricostruisce la storia evolutiva dei gechi diplodactylidi australiani, rivelando come l'aridificazione continentale e i successivi spostamenti di habitat, da ambienti umidi ad arborei verso biomi aridi, abbiano guidato la diversificazione e la divergenza morfologica di questa radiazione nel corso di circa 45 milioni di anni.
Questo articolo introduce un quadro unificato chiamato "analisi invasiva evolutiva strutturale" che, combinando il determinante d'invasione e la Matrice di Proiezione della Prossima Generazione, semplifica l'analisi di popolazioni strutturate complesse garantendo che le proprietà evolutive siano identiche a quelle dei modelli completi.
Questo studio presenta un atlante cellulare unificato del cervello anteriore di undici specie vertebrate, rivelando che l'evoluzione avviene principalmente attraverso la modulazione di programmi trascrizionali profondamente conservati all'interno di identità cellulari stabili, piuttosto che tramite la creazione di nuovi tipi cellulari.
Gli autori hanno sviluppato e validato il kit di sonde Clusioids626, che integra i target universali Angiosperms353 con 273 target specifici per il clade clusioidi, risolvendo con successo le relazioni filogenetiche di questo gruppo recalcitrante di Malpighiales e superando le limitazioni dei pannelli universali.
Questo studio dimostra che la struttura demografica delle popolazioni ospiti è un driver ecologico primario dell'evoluzione della virulenza nei virus vegetali, influenzando la velocità di progressione della malattia, la specializzazione o generalizzazione dell'infezione e le risposte genomiche del virus.
Questo studio analizza la distribuzione degli effetti sulla fitness nelle mutazioni di 38 primati catarrini, concludendo che le differenze interspecifiche sono guidate principalmente dalla variazione della dimensione efficace della popolazione e dall'efficacia della selezione, piuttosto che da caratteristiche specifiche dei cladi, e che la correzione per la demografia permette inferenze robuste.
Attraverso esperimenti di evoluzione robotizzata su diversi ceppi di *Escherichia coli*, lo studio dimostra che l'epistasi specifica per funzione, piuttosto che quella globale, guida traiettorie evolutive divergenti e spesso più lente verso la resistenza agli antibiotici, offrendo nuove strategie terapeutiche basate sull'interferenza con specifiche funzioni cellulari.
Questo studio utilizza il DNA antico di semi di melone della dinastia Song per dimostrare che, sebbene non vi sia stata una domesticazione indipendente in Cina, i meloni dell'epoca erano già stati selezionati per caratteristiche morfologiche e gustative specifiche, come la polpa verde e la forma tonda, riflettendo sia un consumo culinario che le preferenze estetiche del periodo.